安全工程学院成立于2017年9月，其前身为采矿工程系，是学院最具鲜明特色的系部之一，目前与安全监管监察学院合署办公。安全工程学院当前开设高职学历教育的专业有煤矿开采技术、金属与非金属矿开采技术、矿井建设、安全技术与管理、矿井通风与安全、地下与隧道工程技术、工程造价等7个专业，在校生900余人。其中煤矿开采技术专业是国家级精品专业，是国家骨干高职示范院校建设中央财政重点支持建设专业。安全监管监察学院具备国家二级煤矿安全培训资质和国家二级安全生产培训资质。

目前， 安全工程学院下设安全工程、采矿工程、地隧工程三个教研室。现有专兼职教师31人，其中教授2人、正高级工程师1人、副教授6人、高级工程师1人、讲师11人、工程师1人、助教9人，中、高级职称教师占70.96％，有2人被评为全国职业教育煤炭专业带头人。《煤矿灾害防治技术》、《工程爆破》、《矿井通风》为省级精品课程，煤矿开采技术、矿井通风与安全两个教学团队为省级教学团队。“仿真矿井建设及在采煤专业人才培养中的应用”2012年被评为省级教学成果一等奖，“基于工作过程需求导向的仿真矿井建设及在教育教学中的应用”被评为2014年职业教育国家级教学成果二等奖，“基于生产过程的煤矿安全教学案例库构建及应用”被评为2015年教育厅级教学成果奖。原采矿工程系被评为二〇一四年度甘肃省“园丁奖” 先进集体。

安全工程学院现有 “安全”、“采矿”、“岩土工程”三个实训中心，两座现代化仿真矿井，一个盾构工艺实训场，实验实训设备齐全。其中，现代化仿真矿井2009年被国土资源部命名为科研实验类国土资源科普基地；土压平衡盾构机为国产首台教学用盾构机，填补了国内在教学用盾构机上的空白。与窑街煤电公司等40多家单位建立了长期的校企合作关系。依托专业优势，每年为矿山企业培训班组长、管理人员、负责人、特殊工种3000人次以上，面向社会开展成人继续教育服务200人以上；为行业企业提供安全评价，高技能、新技术培训等多项社会服务。近年来,与行业企业合作完成多项科学研究与技术攻关课题。