药学院人才培养的目标是具备药学基本理论、基本知识，掌握药学基本原理及研究方法，能较熟练运用实验研究技能和研究手段从事药物分析、临床药学、药物研究和开发，药物制剂生产与管理等方面知识和能力的复合型高级药学学科高级专业人才。这对中药资源极为丰富的甘肃省而言，具有极为重要的意义。
47年来，药学院已经为社会培养出各种层次的药学人才近万人。现今，药学院培养出来的各种层次的药学专业人才已遍布国内各医药生产、经营、管理行业。这些毕业生在各自不同工作岗位上救死扶伤、成绩斐然，绝大多数成为甘肃省医药事业的脊梁，他们也是药学院的光荣和骄傲。
在各级领导的支持及兄弟院校的帮助下，经过兰医药学几代人的努力与奋斗，教学条件已得到了极大的改善，师资队伍也不断壮大。现今，我院共有教职员工51人（兼职3人），教师系列人员45人，其中35岁以下22人，36—50岁16人，51—60岁7人。按职称划分，正高职人员7人、副高职人员13人，中级职称人员15人，初级职人员职称9人。
药学院下设6个研究所，分别是：药物化学研究所、药剂学研究所、药物分析研究所、生药学研究所、微生物与生化药学研究所及药理学研究所；有1个药学基础实验室，2个专业实验室：中药制剂实验室、中药生药鉴定实验室，另设有一个中草药研究所。
药学院1994年被列为省教育厅重点扶持学科，2002年被评为甘肃省教育厅重点学科。2002年药学院基础实验室被评为甘肃省合格实验室，2003年中药制剂实验室、中药生药鉴定实验室被评为甘肃省中医药科研二级实验室。药学院现有药物化学研究所、药剂学、药物分析、生药学、微生物与生化药学及药理学6个硕士点，共有12名硕士研究生导师，年招生大约为40名左右。
药学院与甘肃省较大规模的兰州大学第一医院、兰州大学第二医院、甘肃省人民医院、三爱堂医院、兰州空军总医院、铁路中心医院、兰州陆军总院等机构建立了长期的教学协作关系，拥有相对稳定的药学见习与实习基地。
学院充分发挥人才优势，广泛开展科学研究，充分利用甘肃丰富的药材自然资源，先后承担了国家、省部厅级科研项目18项，目前在研课题15项，其中，国家科技部支持项目1项，国家教育部项目2项，部级项目2项，省科委项目9项，省教委项目2项。累计发表科研论文近300篇，参与编写正式出版专著11部，有多项教学和科研成果获奖，已逐步成为我省药物、民族药物开发研究及教学科研基地。教师发表的论文有19篇被SCI收录。