电子信息工程学院成立于2008年3月，由原理工学院电子工程系、自动化系组建。
电子工程系 于1979年建系，由原物理系“无线电”专业和原数学系“计算技术”专业合并成立电子学系。1986年（第三批），获“信号与信息处理”硕士学位授予权。1988年，原属电子学系的“计算机”专业独立建系，电子学系改称电子工程系；同年“无线电”专业调整为“电子学与信息系统”专业。1994年增设“通信工程”专业；1995年，“电子学与信息系统”专业调整为“电子信息科学与技术”专业。2005年，获批“电子与通信工程领域”工程硕士学位授予权。2010年，获“信息与通信工程”一级学科硕士学位授予权。是自治区第一个建成的电子学专业，也是自治区唯一具有电子类硕士学位授权的系。
自动化系 自动化专业于1993年开始筹建，1994年招收第一届本科生，1999年原物理系“工业自动化”专业与电子工程系“自动控制”专业合并成立自动化系，并入理工学院；2000年（第八批），获批“模式识别与智能系统”硕士学位授予权；2007年，获批“控制工程领域”工程硕士学位授予权。
电子信息工程学院现有1个一级学科工学硕士学位授权点：信息与通信工程；1个二级学科工学硕士学位授权点：模式识别与智能系统；2个专业学位硕士授权（含工程领域）点：电子与通信工程领域和控制工程领域；3个本科专业：电子信息科学与技术、自动化、通信工程，均为自治区级品牌专业；1个自治区重点培育学科：信号与信息处理；5门自治区级精品课程：自动控制原理、微机原理与接口技术、模拟电路、通信原理、传感器与检测技术；1门校级精品课程：电路分析基础；1门校级双语教学课程：计算机网络；1个自治区级实验教学示范中心：电子信息技术实验教学中心；1个自治区级工程中心：内蒙古自治区电子工程技术研究中心。在校的学术型硕士研究生90余人，专业学位硕士研究生30余人，工程硕士学位研究生120余人，本科生800余人。
电子信息工程学院现有教职员工50人，其中：教授7人，副高级职称教师21人，其中具有博士学位教师11人；博士生导师1人、硕士生导师15人。
学院设有“模拟电路”、“数字电路”、“电路分析”、“信号与系统”、“通信原理”、“高频电路”、“电视原理”、“嵌入式系统与EDA”、“现代通信网络”、“信号与信息处理”、 “微机与接口电路”、“自动控制”、“工业控制系统”、“单片机技术”、“传感与检测技术”、“自动化仪表”、“电机与电力拖动”、“模式识别与智能系统”等实验室。
电子信息科学与技术专业 是自治区级品牌专业，本专业要求学生系统掌握电子信息系统的基本理论和专业技能，掌握信息采集、传输、处理的基本理论和技术以及计算机软、硬件的设计调试方法。为学生提供严格的现代电子学实验的训练和科学研究训练，培养电子信息系统及相关领域中从事科研开发、工程技术方面的高级专业技术人才。
通信工程专业 是自治区级品牌专业，要求学生系统掌握通信领域内的基本理论和基本知识，掌握交换、光纤通信、移动通信、多媒体通信技术及通信系统和通信网络的分析、设计、开发、调试、应用能力。培养通信领域中从事研究、设计、制造、运营以及在相关部门从事开发、应用通信设备等工作的高级技术人才。
自动化专业 是自治区级品牌专业，按照“加强基础、拓宽方向、注重综合素质和应用能力培养”的办学思路，面向信息化和高新技术的发展，培养具有系统的自动化理论基础，掌握现代控制技术和信息技术的宽口径、高质量人才。
电子信息工程学院承担省部级以上科研项目多项，近年来获得各项科研经费400余万元，近五年来发表论文230多篇，其中SCI、EI、ISTP收录100多篇，出版专著30余部。 经过连续三期“211”工程建设和“中央与地方共建特色实验室”项目和日元贷款项目的建设，学院教学设施完善，仪器设备齐全，本科实验教学与科研设备已经达到国内先进水平，为培养学生的创新能力提供了条件。
电子信息工程学院本科生第一志愿录取率为100％，三个专业在内蒙古大学各专业录取分数历年排名位于前五名内。本科毕业生就业一次签约率历年均在94％以上，本科生升研率达20％以上。本学院各专业仅招收外语语种为英语的考生。
学院始终贯彻“加强基础，重视应用，注重学生素质和能力培养”的方针，在培养高层次人才方面积累了丰富的经验。毕业生具有很强的竞争优势，遍布海内外，成为通信、邮电、广播电视、航空与交通、公安边防、金融财贸、教育科研、大型企业等各条战线上的骨干技术力量，就业前景广阔。
教师指导研究生
学生在计算机房做课程练习
自动化系 自动化专业于1993年开始筹建，1994年招收第一届本科生，1999年原物理系“工业自动化”专业与电子工程系“自动控制”专业合并成立自动化系，并入理工学院；2000年（第八批），获批“模式识别与智能系统”硕士学位授予权；2007年，获批“控制工程领域”工程硕士专业学位授予权。2008年3月，自动化系与电子工程系合并成立电子信息工程学院。
自动化专业是自治区级品牌专业，按照“加强基础、拓宽方向、注重综合素质和应用能力培养”的办学思路，面向信息化和高新技术的发展，培养具有系统的自动化理论基础，掌握现代控制技术和信息技术的宽口径、高质量人才。
自动化系设有“微机与接口电路”、“自动控制”、“工业控制系统”、“单片机技术”、“传感与检测技术”、“自动化仪表”、“电机与电力拖动”、“模式识别与智能系统”等实验室。
自动化科学与技术在当代发展极为迅速、应用极其广泛、是引人瞩目的高新科学技术。自动化专业要求学生基础宽厚，计算机综合应用能力强。毕业生具有很强的竞争优势，就业前景广阔。毕业生可以报考控制类和信息类的硕士研究生。在区内外的科研与科技开发、部队与国防建设、信息产业的生产与运行、大型工业企业、大专院校以及各类科技公司和部门受到了欢迎。