1994年，教育部批准南开大学哲学系为“国家文科基础学科人才培养和科学研究基地”，是全国仅有的7个同类基地之一。2008年10月，哲学系哲学类专业获批为“教育部‘质量工程’第一类特色专业建设点”。2010年6月，南开大学哲学系正式更名为南开大学哲学院。哲学院按“哲学类”招收本科生，学生入学一年半后自愿选择哲学专业或逻辑学专业就读。该学院自2002年起实行“本科生全程导师制”，一、二年级配备班级学术导师，三、四年级配备个人导师，负责指导每位学生的论文撰写和研究。本科生入学后享受奖学金的比例达80％以上，困难学生可通过勤工助学获得各种资助。除国家、校级奖助学金外，哲学院另设有“慈心助学金”、“尹沧海奖助学金”、“豫华九逻辑学奖学金”、“公能励志奖学基金”等，专门资助本院学业优秀或生活困难学生。哲学院自1962年恢复重建以来，培养了大批优秀毕业生，其中有学术界的著名专家、学者；有担任党、政、军各部门的重要职务的毕业生，如现任天津市政协主席邢元敏、前中国证监会主席郭树清等。
哲学院现有专职教师42名，其中教授18名（均为博士生导师）、副教授15名。所有教师均开设本科生课程，并担任本科生个人导师。近年来，多名教师入选教育部“跨世纪优秀人才培养计划”、人事部“新世纪百千万人工程”国家人选、教育部“高等学校优秀青年教师教学科研奖励计划”、“新世纪优秀人才培养计划”，并先后有多名教授入选中央“马克思主义理论研究与建设工程”等。
为提高教学科研水平，哲学院建立了完善的现代化教学研究设备，开发多媒体和网络教学手段，有完善的图书资料管理系统。除校图书馆拥有本学科图书外，哲学院资料室收藏专业图书几万册、学术刊物一百多种，并设有小型阅览室。
近年来，哲学院承担国家社会科学基金项目、教育部及天津市社会科学研究项目100余项，出版学术专著、译著、教材200多种，发表学术论文1000多篇，有80多个项目荣获国家及天津市社会科学优秀成果奖。
哲学院与欧美及港台多所知名大学有密切的学术交流和互派学生的关系，曾多次承办国内外具有相当影响的学术会议。近年来，每届本科生中均有同学赴国外或境外交流学习。哲学院拟从2013年起，在夏季学期期间集中选派优秀本科生到国外著名大学进行学术交流。
哲学专业
哲学专业历史悠久，师资力量雄厚。该专业旨在培养德智体全面发展、掌握哲学专业知识并兼通其它专业知识的人才。要求学生掌握马克思主义哲学的基本理论和方法，熟悉马克思主义哲学的历史，了解中外哲学的历史和当代哲学思潮，具有一定的社会科学、自然科学和思维科学的基础知识，有较强的理论思维能力、语言表达能力、社会活动能力和初步的科研能力。
该专业基础课主要有哲学概论、马克思主义哲学、西方哲学、中国哲学、逻辑学导论、科学哲学导论、伦理学导论、宗教学导论、美学导论、哲学研究与写作、马克思主义哲学经典与历史、西方马克思主义哲学导论、当代马克思主义哲学、认识论、形而上学、西方哲学原著、中国哲学原著、佛教哲学、儒家哲学等。
毕业生的就业去向主要为哲学社会科学研究机构、高等院校、广播电视及新闻出版单位、党政领导机关、大型企业的党政领导部门等。2012届毕业生中，免试推荐及考取研究生比例26.1%，出国比例10.9%，就业比例63%。
逻辑学专业
逻辑学专业是我国高校中成立的第一个同类本科专业，全国现存的两个本科专业之一。该专业的培养计划突出逻辑学与科技哲学的结合与融通，以造就适应现代社会需要的高素质人才。该专业培养德智体全面发展、掌握本专业知识并兼通其它专业知识的逻辑学专门人才，要求学生比较系统地掌握逻辑学专业的基础知识、专业知识以及马克思主义哲学的基本理论和方法，具备扎实的社会科学、自然科学和思维科学的基础知识，有较强的理论思维能力、社会活动能力、科研能力和表达能力。
该专业的基础课程有哲学概论、马克思主义哲学、西方哲学、中国哲学、逻辑学导论、科学哲学导论、伦理学导论、宗教学导论、美学导论、数理逻辑、哲学逻辑、西方逻辑史、中国逻辑史、科学通史、科学方法论等。
毕业生的就业去向主要为高等院校、广播电视及新闻出版单位、党政领导机关、大型企业的党政领导部门等。