生物工程学院是我校成立最早的二级学院，现设药品生物技术、生物制药技术、药学、药品生产技术、农业生物技术、药品经营与管理、中药生产与加工等六个专业。面向全国招生，目前在校生1300余人。其中，药品生产技术、生物制药技术专业为中央财政支持重点建设专业和湖北省高等职业教育特色专业。

学院拥有一支学术造诣精深、富有创新精神、敬业爱岗的师资队伍。其中享受国务院津贴的专家1人，湖北省有突出贡献的中青年专家1人，湖北省“楚天技能名师”2人，学院专业带头人4名，骨干教师8名，教授1人、副教授12人，高级工程师3人，执业药师3人。具有博士学历2人、硕士等研究生学历36人，“双师型”素质的教师28人。

学院始终坚持以生为本，重视学生职业技能培养，通过工学结合、订单培养等多种人才培养模式，提高了学生职业能力和职业素养，学生在各类职业技能大赛中取得了优异的成绩。2018年，全国职业院校技能大赛高职组“农产品质量安全检测”赛项中，我院代表队以总分第一的成绩荣获一等奖。全国职业技能大赛“工业分析与检验”赛项中，我院首次代表湖北省高职院校出赛，荣获团体三等奖。2017年，湖北省茶叶中重金属含量检测赛项中荣获一等奖。2016年，学院组队代表湖北省高职院校参加全国职业院校技能大赛，荣获农产品质量安全检测赛项一、二等奖，2018年成功承办农产品质量安全检测国赛。同时，学院大力支持学生创新创业。2017 年，14级药学专业学生赵兴典荣获了湖北省第三届“长江学子”创业奖。

学院坚持以培养复合式创新型高素质高技能人才为中心，以深化教学内涵建设为主线，不断创新教育理念、深化教学改革、提高教学质量。目前《生物分离与纯化技术》被评为省级精品课程。同时，学院坚持走产学研相结合道路，鼓励教师开展社会服务。艾炎军博士连续三年被企业推荐为科技厅“三区服务科技人员”，并于2016年赴英山县为农民种植蓝莓。为提高学生职业能力，学院经过多年的建设与投入，建成了融教学、生产、服务、示范为一体的稳定的校内外实训基地。现有等个12个专业实训室，拥有1个校内实习基地和20余个校外实训基地。稳定的校内外实习实训基地，保证了实践教学的顺利进行，提高了学生的实践技能。

学院坚持以就业为导向，以能力为本位，创新人才培养模式，培养技术技能型人才。目前，已同马应龙药业集团、益丰大药房、武汉长联来福、武汉药明康德新药开发有限公司、武汉科前生物生物制品有限公司、湖北牧童蓝莓科技公司等企业签订了校企挂钩协议，基本实现了“订单”培养；与武汉生物工程学院本科院校联合创办了“专本连读”办学模式。自学院建立以来，为社会输送了毕业生近7000余名，就业率达到96％以上，毕业生专业技能扎实，综合素质高，受到用人单位的一致好评。