学院设有博士授权点和硕士授权点12个，分别为人体解剖学与组织胚胎学、病原微生物学、免疫学、生理学、生物化学与分子生物学、药理学、病理学与病理生理学、生物医学工程学、法医学、医学生物化学与细胞生物学、医学神经生物学、医学生理学与时间生物学；博士后流动站3个：基础医学、生物医学工程学、生物学。其中：生物化学与分子生物学、病理生理学、法医学、生理学、人体解剖学与组织胚胎学为省级重点学科；法医学为国家级重点学科。生理学、人体解剖学、组织学与胚胎学、生物化学、医学微生物学、法医学、病理生理学、法医物证学为省级精品课程；法医物证学为国家级精品课程。基础医学被评为国家级理科人才培养基地；法医学为省级特色专业，专业排行位居全国第一。基础医学一级学科列全国第五。
学院历来十分重视科学研究，坚持教学、科研同步发展。有浓厚的学术研究氛围，良好的学风，孕育出享誉中外学术界的刘承钊院士等一大批知名专家教授。自2001年以来获部省级科技成果22项。近五年来，我院承担了大量国家和地方科研项目，其中国家级科研项目（包括重点和重大项目）63项，省部级基金27项。科研成果丰硕，申报和批准专利30项，发表SCI、EI收录论文200篇。学院与美国、德国、新加坡等国家以及香港、台湾和内地众多高校、科研院所及企业保持着良好的合作关系。
学院注重与国内外的学术交流，改革开放以来有近200人出国学习、交流、攻读学位，其中半数已经回到工作岗位并成为各学科的骨干，同时每年接待多名国内外专家教授来院讲学与交流合作。
经过几年的建设，华西基础医学与法医学已成为四川大学医学发展的中坚力量，师资队伍素质高，教学设施先进，科研力量强。学院按照学校的办学理念，正在实施“三个规划”的发展目标，朝着研究教学型学院转化。
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