海洋学院成立于 2002 年 7 月。建院以来，学院依托海南丰富的海洋资源，以热带海洋资源研究、开发利用和保护为特色，创办与经济建设紧密联系的专业，发展海洋科学技术，为我国海洋现代化建设输送各类应用型高素质人才。经过多年的建设，学院的师资队伍建设、学科建设、办学规模、科学研究和实验室建设都得到了快速发展，并获得了许多荣誉称号。2007年学院被授予海南省教育系统先进集体；2005年、2007年海洋生物实验室被评为省优秀实验室；水产系被全国总工会命名为“全国先进班组”，荣获“五一劳动奖状”，有多位教师获得各种荣誉和表彰。成为海南省海洋科学领域科学研究和人才培养的主要基地 。
学院现有教职工 60 名，其中教师48名，具有副高以上专业技术职务者33人，具有博士学位21人，硕士学位19人，学院特聘林浩然院士为双聘院士。享受国务院津贴专家 4人、省优专家2人，全国先进工作者 2 人， 新世纪“百千万人才工程”国家级人选2 人、新世纪优秀人才支持计划人选 1 人、全国优秀教师 1 人、海南省教学名师1人和海南省高等院校青年教师“教学十佳” 1 人。形成了一支思想政治素质高，爱岗敬业，学历较高和职称结构合理的，能够满足教学和科研需要的师资队伍。
学院设有水产养殖专业、制药工程专业、海洋科学三个本科专业，水产学、药学二个一级学科硕士学位点，海洋生物学一个二级学科硕士学位点和一个渔业领域农业推广硕士点，海洋生物实验教学中心,生物技术中心;热带生物资源教育部实验室的海水动物繁育和病害控制研究室、海水动物种质改良研究室、海洋生物研究室；海南省热带水生生物重点实验室。2003年经海南省科技厅批准成为海南 —东盟科技合作基地，2007年“水产养殖专业”被教育部、财政部批准为第一类高等学校特色专业建设点。 目前有在校研究生60多人，本科生 680多人 。
学院有海南省级重点学科—水产养殖学、校级重点学科—海洋生物学。水产养殖学设有热带水产养殖生物生殖调控与繁育、热带水产养殖生物遗传育种、热带水产养殖生物病害与控制、热带水产养殖生物开发利用生物技术等四个重点研究方向。海洋生物学设有应用海洋生物技术、海洋生物资源的保护与开发利用两个研究方向，热带海洋经济动物的繁育与海洋生物利用”是学校“211工程”重点建设项目。
学院海洋生物实验教学中心是国家级实验教学示范中心灰意懒建设单位，下设养殖学实验室、生物学实验室、生物技术实验室、药学实验室、海洋生物实验室、海洋环境生态实验室和热带水生生物技术实验室。拥有力量较为雄厚的实验教学队伍, 美观、宽敞的实验教学大楼和先进的仪器设备 。实验室总使用面积为 3596 m2 ，教学仪器设备总值931万元。承担着学院三个专业的实验教学任务。2005年、2007年海洋生物实验室被评为省优秀实验室；2006年中心被批准成为海南省省级实验教学示范中心建设点，2008年被评为教育部实验教学示范中心建设单位。学院与企业联合建立了 15个校外科研、教学实习基地。 学院十分重视科技成果的转化工作，为地方经济社会发展提供科技服务，在省科技厅的支持下，学院与海南省多家水产养殖与科研单位合作，建设有石斑鱼育苗与养殖、东风螺健康养殖技术、扇贝优质苗种繁育和无公害养殖、泰国笋壳鱼人工繁育与高效养殖示范、花鳗鲡种苗驯养与集约化养殖技术开发等科研、教学示范基地，推广各类石斑鱼的人工育苗（池塘育苗、工厂化育苗）、石斑鱼的池塘养殖、网箱养殖、东风螺规模化优良苗种繁育，东风螺健康养殖等技术。“ 点带石斑鱼规模化人工繁育技术研究”实现了点带石斑鱼规模化人工繁育，成果总体达到国际先进水平，以“碎屑食物链”为基础的点带石斑鱼工厂化育苗技术属于国内外首创。国家领导人曾多次视察学科的产业化基地。学科建设大大提升了学院的教学质量、科研水平和为社会服务能力。既培养了学生的创新能力和动手能力，又取得了良好的社会效益和经济效益。学院被省科技厅授予“海南省科技特派员工作站”单位。
学院设有学校图书馆二级馆，藏有多种专业科技期刊和书籍，有过刊 286 种，共 4934 册（合订本），现刊 67种；藏书量 2421 种，共 4230 册。 配备有公用上网电脑。
学院坚持以理想信念教育为核心，以服务学生成长成才为原则，以培养具有创新精神和实践能力的大学生为目标，在“建设、服务、创新”的工作理念指导下，充分挖掘工作内涵，不断创新工作内容，打造了“学生科研能力训练营”、“传递爱心 成就你我 共筑和谐——海洋学院资助家庭经济困难学生系列活动”、学生党员“四个一”工程等精品活动，开展了校园十大歌手、辩论赛、演讲比赛、征文比赛等一系列丰富多彩的校园文化活动，尤其是在历届“挑战杯”全国大学生课外科技作品竞赛和中国大学生创业计划竞赛均取得了较好的成绩，学生科研工作走在学校的前列。学生综合素质较高，普遍受到用人单位欢迎，我院2008届毕业生初次就业率达到了92.56%。
学院近期发展规划以设立应用性学科为主，中期发展规划为在加强应用型学科基础上，逐步发展基础学科；学院的长期目标是以南海热带海洋为依托，构建较为完整的海洋科学研究、教学体系，成为我国热带海洋科学的教学、研究基地。为国家培养具有扎实基础理论和操作技能的 21 世纪创新型人材，为发展我国海洋经济做出贡献。