学院现有建筑系、土木工程系、城市规划系三个系级教学单位，另有建筑与规划研究所、海峡两岸城市规划所、岩土工程与灾害监测研究所、交通研发中心等研究机构。学院拥有建筑学、土木工程、城市规划３个本科专业，并设有建筑学、土木工程、力学3个一级学科硕士点及建筑与土建学科工程硕士学位授权点。
学院建筑学、土木工程学科于2012年被评为“福建省省级重点学科”。
学院现有建筑材料实验室、建筑造型实验室、建筑物理实验室、数字化设计实验室、建筑材料与构造实验室、材料力学实验室、岩土工程实验室、土木工程测量实验室、结构工程实验室等9个专业实验室，配备有专业教室、美术教室、多媒体专用教室、制图教室等教学场所，学院设有专用资料室，藏有专业中外文图书资料14355册、中外文期刊近百种及相关声像资料等。
建筑系于1987年由东南大学建筑系协助创办，并派遣了郭湖生、卢志昌两位教授来系主持工作。1990年代以来，在黄仁教授和后任的凌世德教授为领导的几届班子的带领下，建筑系步入快速发展时期。1999年获“建筑设计及其理论”专业硕士学位授权点，2003年通过了“全国高等学校建筑学专业教育评估”，获得“建筑学学士”专业学位授予权。2005年获得“建筑学”一级学科硕士学位授予权 。2007年通过了“全国高等学校建筑学专业教育评估”复评，申请并通过了“全国高等学校建筑学硕士学位研究生教育评估，获得了“建筑学硕士”专业学位授予权。2011年再次顺利通过复评。
土木工程系是厦门大学的老学科之一， 1938开始招生，培养了一批土木工程专业人才，曾在国内外具有相当影响，美国工程院院士林幼堃先生、我国著名岩土工程专家曾国熙先生及全国工程勘察大师吴自迪先生就是毕业生中的杰出代表。由于全国学科调整，1953年停办。1999年经教育部批准，恢复了该专业招生，2003年获“结构工程”硕士学位授权点，2004年复办土木工程系，2005年获得“土木工程”、“力学”两个一级学科硕士学位授予权并获得建筑与土建学科工程硕士学位授权点。
城市规划系于2007年正式成立，在首任系主任马武定教授的领导下，城市规划系发展取得良好的进展。现设有城市规划专业，具有本科（工学学士）和研究生（工学硕士、工程硕士）学位授予权，并与英国卡迪夫大学合作共同培养双硕士学位研究生。城市规划系发展坚持教学与科研并重、积极对外交流，2009年厦门大学城市规划系成为《城市规划学刊》协办单位，同年5月经学校批准成立海峡两岸城市规划研究所。
学院在培养人才方面形成了以下特色：（一）坚持以教学为中心，教学、科研与工程实践紧密结合，以科研和工程实践促进教学。多年来承担并完成了多项国家和省部级科研任务以及数十项工程项目的研究和设计工作，并有多项成果获省部级科研奖或优秀设计奖等，得到了社会的好评，取得了良好成果。这一切既提高了教师队伍的水平，也使学生在实践中掌握课本上学不到的知识。我院学生在全国大学生建筑设计竞赛中连续多年榜上有名，近年在国际及区域性建筑设计竞赛中取得了第一名一项，二、三等奖及优秀奖多项的优秀成绩，在土木工程全国性学业竞赛中我院学生多次获奖，争得了良好声誉；（二）树立“综合素质教育”观念，不断充实、调整教学计划，并充分利用学校综合学科的优势，以“基础、技术、能力、理论、交叉”五个模块建立学科的培养体系，使教学质量稳步提高；（三）坚持厚基础、强过程、重能力、多规格培养人才，既培养富有创造力的应用型的设计人才，专业化的建筑或房地产开发与经营管理人才；又培养建筑、土木工程理论的研究型人才，使学生各施所长，受到了社会和用人单位的好评。
学院在创办专业的同时，参与组建了建筑设计研究院，并于1998年获甲级资质，形成了教学、科研、生产实践相结合的教育机制和具有研究生、本科生多层次办学体系。