历经百余年的春华秋实和六十载的风雨征程，医学院秉持“团结、勤奋、求实、进取”的院训及“博极医源、精勤不倦”的学院精神，始终以谋国家之强盛、求科学之真知、践医学之神圣为己任，与时代同呼吸、与社会共命运，在医疗卫生事业的壮美画卷中留下了诸多浓墨重彩的笔触，为社会输送了7万余名医学人才。学院现已发展成为一所享有较高国际声誉，优势特色明显，师资力量雄厚，学术成绩卓著，集医、教、研以及社会服务全面发展的研究型院校。
医学院坚决贯彻“人才强院”的主战略，切实加强高层次人才队伍建设，大师云集、人才荟萃。现有教职医务员工22707名，专任教师634名，在职高级职称2433人，博导541名，硕导948名。其中包括中国科学院院士1人，中国工程院院士11人，第三世界科学院院士2人，欧洲科学院外籍院士1人，美国科学院外籍院士1人，法国科学院外籍院士2人，美国医学科学院外籍院士1人，法国国家医学科学院院士1人，国际牙医学院院士1人，中组部“千人计划”11人，“青年千人”5人，国家“973”项目首席科学家10人（13项），长江学者特聘教授和讲座教授18人，国家杰出青年基金获得者20人。国家级教学团队1个，国家级教学名师1人，上海市教学团队5个，上海市教学名师8人。2011年，我院王振义院士荣获国家最高科技奖。
医学院持续推动教育教学改革，不断加强以基地建设与临床优势为依托，以转化医学理念内涵的“卓越医学教育”体系建设，注重学生医学与人文、生理与心理、知识与能力、求真与道德融通培养。
医学院现拥有重庆南路、闵行、南汇三个校区，包含21个学院（系），13所附属医院，1所卫生学校。覆盖生物学、基础医学、临床医学、口腔医学等8个一级学科博士学位授权点、4个一级学科博士后流动站。有临床医学八年制（授予博士学位）、口腔医学七年制（授予硕士学位）和6个本科专业（临床医学、口腔医学、预防医学、医学检验、护理学、营养学），其中，临床医学、口腔医学、医学检验、护理学为国家特色专业；临床医学八年制（法文班）与（4+4硕博班）、临床医学五年制（儿科学方向）与（英语班）是学院的特色班级。目前在校学生7019名，其中本科及长学制学生3151名，研究生3616名，留学生252名。2010年起，医学院深度参与上海市住院医师规范化培训工作。每年招收200名左右住院医师专业学位研究生，占到上海市招录总数的近一半。
历年来，我院共获得国家级教学成果奖8项，国家级精品课程15门，国家级双语课程3门。我院信息中心图书总藏量达57.8万册，覆盖医学各学科，为国内重点收藏单位，也是全国法文医学特藏中心。
作为国家级临床技能实验示范中心学科组长单位，我院具有临床模拟功能齐备、师资团队雄厚、医疗资源丰富、操作平台先进的基地优势，并通过器官系统整合式课程、临床技能操作、客观化临床考试实现全面提升医学生临床技能和创新意识。2012年成功主办全国首届中华临床医学教育与模拟医学教学大会。同年入选教育部第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，担任上海市卓越医学教育计划专家组组长单位。
21世纪恰逢医学生命科学的战略机遇期。我院紧紧围绕基于转化医学理念的学科建设和人才培养主题，整体布局、重点突出，全力推进国家转化医学重大科技基础设施项目的建设。现有国家教育部重点学科(三级学科)16个，即：内科学（含8个）、整形外科学、骨外科学、儿科学、神经病学、口腔临床医学、口腔基础医学、遗传学、病理学与病理生理学，上海市重点学科18个。上海高校一流学科9个（临床医学、基础医学、药学、生物学、口腔医学、临床医学外科、临床医学内科、公共卫生与预防医学、医学技术）。
根据2013年1月29日教育部学位与研究生教育发展中心最近公布的2012年学科评估结果，我院临床医学全国排名第一、口腔医学排名第二、基础医学排名第三、护理学排名第五、公共卫生与预防医学排名第十，标志着我院学科综合实力稳居全国前列。
医学院瞄准科学技术发展这一重要生产力，瞄准国家《医学科技发展“十二五”规划》和《“十二五”生物技术发展规划》方向，深化科研体制改革、聚焦优先发展领域，科学统筹科研项目，着力推动医工、医理等学科的交叉与合作，基础研究面向国际学术前沿，应用研究面向国家战略需求和卫生医疗水平提升。科学研究与科技创新水平持续提高，科研成果丰硕、成绩斐然。
医学院共获得国家级科技成果奖67项，其中国家最高科学技术奖1项，国家自然科学奖5项，国家技术发明奖10项，国家科技进步奖51项。近五年来，我院国家自然科学基金项目数累计达1544项，2012年获得489项，同比增长26%，连续三年稳居全国第一。2011年度，发表SCIE论文1527篇，医学学科SCI收录论文数再次名列全国第一。2005年-2012年我院获全国优秀博士学位论文4篇，提名奖16篇。
医学事业承载着祖国卫生事业发展之大计，关乎于社会百姓健康维系之命运。在全面贯彻落实国家医疗卫生体制改革项目的基础上，我院各附属医院不断提升医疗卫生服务水平。现共有13所附属医院，其中8所综合性医院、5所专科性附属医院。各附属医院具有高水平的临床医疗实力，拥有一批蜚声中外的临床医学专家，曾在各个历史阶段时期创造了一批医学史上的奇迹。
在2012年公布的《2011年度中国最佳医院排行傍》中，附属瑞金医院保持在排名全国第四的高位。在19所入围的上海市医院中，我院有9家。目前医学院系统共有53个国家重点临床专科，数量占上海市国家级临床重点专科总数的53%。
2012年，各附属医院门急诊人次达2500.25万，开放床位数15226张，出院人次62.49万，住院手术人次37.15万。并与上海长宁区政府、奉贤区政府和闵行区政府签订了合作共建协议，推进地区医疗发展。与上海市疾病预防控制中心等单位建立实质性合作，推动公共卫生学科建设和发展。
医学院持续深化国际合作，注重对外交流，医学教育国际化水平不断提高。已与19个国家和地区的63所大学及科研机构开了了广泛的合作。聘请了200余位国外专家作为学院的名誉教授、顾问教授和客座教授，举办了300余次有影响力的国际学术会议。并与世界卫生组织、美国世界健康基金会、世界大学法语联盟有着广泛的合作。2012年10月24-25日，与国际医学院校联盟（Association of Academic Health Centers，AAHC）合办世界知名医学院校长大会暨国际医学院校联盟第三届亚太会议，这是该联盟大会首次在华举办。
目前，我院共签署各类国际合作项目30余项，现有45个短期海外游学项目，2012年共有255名学生，赴14个国家和地区的32所合作院校进行海外游学，游学人数占比36%。
抚今追昔、知史鉴往，继往开来、任重道远，全体上海交通大学医学院人将化梦想为行动，执着医学信念、探索科学真理，凝心聚力、抓住机遇，勇立潮头、敢为人先，为努力创建世界一流的医学院，为祖国医疗卫生事业的进步不懈努力。