土木工程学院设有土木工程和理论与应用力学两个本科专业，按土木工程大类招生。设有建筑工程、岩土与地下工程、土木工程材料三个专业方向和一个土木工程力学精英班（按4+2目标培养），在入学第四学期选择专业方向。结构工程、岩土工程、防灾减灾工程及防护工程、工程力学为博士点学科，固体力学为硕士点学科。拥有土木工程和力学两个一级学科博士后流动站。
土木工程学院拥有“结构与抗震减震”、 “寒冷地区混凝土工程病害与防治”两个部级重点实验室及“寒区低碳建筑”黑龙江省工程研究中心。拥有风洞与浪槽联合实验室、岩土与地下工程实验室、国防抗爆与防护工程实验室、结构智能监测实验室、土木工程低温实验室5个特色实验室及土木工程高性能计算中心，与美国、俄罗斯等国家的研究机构共同成立了6个国际联合实验室。学院还拥有土木工程大学生实验创新中心。
土木工程学院现有教职工140人，其中专职教师109人。拥有王光远、沈世钊、谢礼立、欧进萍等4名中国工程院院士，拥有国家教学名师王焕定教授，拥有长江学者李惠教授和郑文忠教授，拥有教育部新世纪优秀人才6人，博士生导师34人，教授39人，副教授43人，具有博士学位的教师82人。此外，有6位境外国际知名学者受聘客座教授和博士生导师。
土木工程学院拥有在国内外有一定影响的“大跨空间结构”、“高层建筑钢结构与轻钢结构”、“钢管混凝土结构与组合结构”、“现代预应力混凝土结构”、“配筋砌体结构”、“海洋平台结构”、“工程质量评定与加固改造”、“结构损伤与可靠度设计”、“结构振动控制”、“结构软设计理论”、“地震工程”、“地基与基础工程”、“岩土工程灾害与防治”等优势领域，近三年科研经费7990万元，获国家科技进步二等奖1项、省部级奖项11项，发表学术论文1185篇，其中被SCI检索126篇、EI检索468篇、ISTP检索115篇。
土木工程学院一直坚持教学、科研、学科建设并重的原则，2003年秋以来，1位教师被评为国家级教学名师，有4位教师被评为省级或校级优秀教师，有2位教师被评为省优秀思想政治工作者，有1门课程被评为国家精品课程，有4门课程被评为省精品课程，有8门课程被评为校优秀课程。结构力学教学团队被评为省级教学团队，“结构力学立体化教材建设”获黑龙江省优秀教学成果一等奖和哈尔滨工业大学优秀教学成果一等奖，“结构概念、体系和选型”获哈尔滨工业大学优秀教学成果一等奖和黑龙江省优秀教学成果二等奖，“钢结构课程体系的研究与实践”获优秀高等教育科学研究成果三等奖，编著出版有重要影响高水平教材17本。
土木工程学院与国际知名大学建立了广泛的合作关系，已与美、英、日、俄、法、德、瑞士、香港等十多个国家和地区的著名大学签署了人才培养与科研合作协议。与美国加州大学圣地亚哥分校共建HIT-UCSD海外学术合作基地，与美国普渡大学、英国帝国理工学院、伯明翰大学、澳大利亚悉尼大学、法国里尔大学、意大利都灵理工大学等国际知名大学联合培养本科生和研究生。
除国家人民奖学金外，在广大校友及社会知名企业大力支持下，土木工程学院还设有多项土木工程专项奖助学金，每年约有130人获得奖（助）学金，包括：徐增全奖学金（每年奖励12人，5000元/人），“未之星”助学金（每年资助25人，4000元/人），建设集团奖学金（每年奖励18人，4500元/人），“菁华基金”奖学金（每年奖励18人，5500元/人），“栋梁基金”奖学金（每年奖励10人，5000元/人），爱之源奖学金（每年奖励24人，5000元/人），“宏业基”岩土专项奖学金（每年奖励20人，5000元/人），建材北京校友会奖学金（每年奖励若干人，5500元/人）等。
土木工程学院办学思路清晰、定位准确，正朝着建设国际一流土木工程学科和国际一流土木工程学院的目标迈进。